锦州医科大学诞生于解放战争时期，学校前身为1946年在吉林省洮南市成立的辽吉军区卫生学校。1949年迁址辽宁省锦州市，1958年成立锦州医学院，2006年更名为辽宁医学院。2007年以优秀的成绩通过国家教育部本科教学工作水平评估。2016年3月，经国家教育部批准，正式更名为锦州医科大学。经过70余年的发展已成为一所以医学为主，多门类、多层次、多种办学形式的省属普通高等院校。
校园总占地面积994987.60㎡。有普通高等教育、成人教育、高等职业技术教育和留学生教育4种办学形式；有研究生、本科生、专科生3个办学层次；有医学、工学、农学、管理学、教育学、经济学6个学科门类；有24个本科专业。学校1984年成为硕士学位授予权单位，1999年获得具有同等学力人员申请硕士学位授予权资格，2003年经教育部批准开始与中国医科大学联合培养博士研究生。现有8个一级学科硕士学位授权点，59个二级学科硕士学位授权点，5个硕士专业学位授权点。
学校有“长江学者奖励计划”2人，国家教学名师奖获得者1人，教育部高等学校教学指导委员会委员3人，新世纪百千万人才工程国家级人选1人，国务院政府特殊津贴获得者23人，辽宁省优秀专家3人，“辽宁省高等学校攀登学者支持计划”入选者5人，辽宁省教学名师奖获得者10人。
学校始终坚持教学工作的中心地位，以立德树人为根本，不断深化教学改革，加强教学管理，提高人才培养质量，教学成果丰硕。学校现有国家级一流本科专业建设点2个，国家级特色专业1个，国家级综合改革试点专业1个，省级一流本科专业建设点2个，省级综合改革试点专业3个，省级工程人才培养模式改革试点专业1个，省级创新创业教育改革试点专业1个，省级示范性专业3个，省级特色（品牌）专业5个。省级精品课程14门，省级精品资源共享与视频公开课7门，省级教学团队6个。省级实验教学示范中心8个，省级虚拟仿真实验教学示范中心5个，省级虚拟仿真实验教学项目3个，省级大学生实践教育基地12个。
学校顺应国际医学教育发展趋势，于1991年率先在国内开展了“以器官系统为中心”的医学课程模式改革，打破了“以学科为中心”的传统课程模式，为我国高等医学教育改革提供了成功范例，开创了我国高等医学教育多种课程模式并存的局面，受到国家教育部、卫生部的高度重视，被教育部批准为“面向21世纪高等医学教育教学内容和课程模式改革计划项目”。该项改革获国家教学成果二等奖两项，辽宁省教学成果一等奖两项。
学校科研工作起步较早，1978年，学校承担的“稻田皮炎的病因和防治研究”项目在全国科学大会上获重大贡献奖；1980年，学校在“地甲病”和“地克病”的病因和病理学研究上取得了突破性进展，获得卫生部乙级科学技术成果，为我国地方病防治工作做出了重要贡献，学校成为全国“地甲病”和“地克病”研究中心；1988年，学校的“磁性树脂根管充填材料及技术的研究”，获国家科技发明三等奖，填补了国内空白。学校现获批建设辽宁省高等学校重大科技平台2个，辽宁省重点实验室13个，辽宁省工程研究中心1个，辽宁省专业技术创新中心2个，辽宁省临床医学研究中心2个。学校获批辽宁省重点学科4个，其中基础医学学科入选辽宁省高等学校一流学科建设项目立项建设学科。学校主办了《锦州医科大学学报》“自然科学版”和“社会科学版”、《中国医师能力评价》三种刊物。
学校现有全日制在校生12304人，其中本科生7559人。现面向全国31个省、自治区、直辖市招生。2019年生源位次排名继续提升，省内临床医学、口腔医学、医学影像学、麻醉学五年制医学骨干专业生源位于全省前22%；7省市提档分数高于一本控制线，11个省市提档分数高于控制线100分以上。学校1997年开始招收留学生，2012年被教育部批准为“来华留学临床医学专业全英文授课资质院校”，2014年被教育部正式列入接受“中国政府奖学金来华留学生高等院校”，2015年被教育部批准为“招收港澳台地区学生资格院校”，来华留学学历生规模连续三年排名辽宁省第3位。
学校现有各专业教学实习基地128个，其中直属附属医院3所，非直属附属医院8所。附属第一医院是辽西地区最大的三级甲等综合医院，辽宁省三大区域医疗中心之一、国家级住院医师规范化培训基地、全国冠心病介入培训基地；附属第二医院是国家级住院医师规范化培训基地（口腔全科）、中华口腔医学会口腔专业护士培训临床实践基地、辽宁省口腔医学临床技能培训中心、辽宁省口腔健康教育科普基地、辽西地区口腔疾病诊治中心；附属第三医院是三级甲等医院，辽宁省职工工伤康复中心、辽宁省糖尿病防治辽西分中心、辽宁省糖尿病眼病防治辽西分中心。三所直属附属医院为地区医疗卫生事业的快速、协调发展做出了积极贡献。
学校坚持“质量立校、学科强校、人才兴校、作风正校、依法治校”的办学理念，秉承“勤俭办学、克难攻坚”的优良传统，坚持以医学为主，工学、农学、管理学、教育学、经济学等多学科协调发展的思路。高度重视党的建设和思想政治工作，注重加强社会主义核心价值观教育和精神文明建设。先后被评为辽宁省“文明校园”、“花园式学校”；连续十二年被中宣部、教育部、团中央表彰为“全国大学生暑期‘三下乡’社会实践活动先进单位”；先后获得“中国民主同盟先进集体”“中国民主同盟先进基层组织”“辽宁省宣传思想工作先进单位”“辽宁省思想政治工作先进集体”“辽宁省精神文明建设先进单位”“一帮一”育人工程先进集体、“辽宁省思想道德建设示范学校”等荣誉称号。