新疆医科大学，位于乌鲁木齐市风景秀丽的鲤鱼山脚下，是新疆唯一一所独立建制的医学院校。
在毛泽东主席、周恩来总理的关心支持下，学校的前身“新疆医学院”被正式纳入国家“一五”计划156个重点项目之中。学校始建于1954年，1956年7月建成招生。1956年10月15日，首届233名临床医学本科生举行开学典礼。来自上海医学院、北京医学院、中国医科大学、山东医学院等内地十余所兄弟院校的医疗专家、教学骨干组成了新疆医学院首批教学团队。
1998年6月，新疆医学院与新疆中医学院合并成立新疆医科大学，时任中共中央总书记江泽民题写了校名。
2016年8月26日，新疆维吾尔自治区人民政府、原国家卫生计生委、教育部联合印发《关于共建新疆医科大学的意见》，学校正式成为省部委共建高校。
学校秉承“好学、力行、笃医、创新”的校训，以“为党育人、为国育才”为己任，始终坚持社会主义办学方向，把办好党和人民满意的医科大学作为出发点和落脚点，认真解决好“培养什么人、为谁培养人、怎样培养人”的根本问题，扎根边疆、奉献边疆，培养了8万多名优秀医学人才，为守护边疆各族人民生命健康，为边疆少数民族地区经济发展、政治稳定、文化繁荣、科学研究、医疗服务、人才培养、民生福祉、边疆巩固做出了卓越贡献。
学校现有校本部、北校区、明园校区、仓房沟校区，另有位于河马泉新校区的雪莲山校区，占地2165亩。学校下设22个院部，开设26个本科专业，涵盖医学、管理学、理学、文学四个学科门类，形成了以医学类为主，其他学科相辅相成的专业结构与布局。其中有6个国家级特色专业、1个国家级人才培养模式创新实验区、6个自治区重点专业。
全日制在校生18761人，折合在校生24919人。其中普通本科生12165人，全日制硕士研究生3589人，博士研究生311人，普通专科生2133人，成人教育学生9755人。
全校教职工15693人（含附属医院），其中专任教师1328人（另有临床教师4580人），具有高级职称教师占专任教师总数的60.77%，具有硕士、博士学位教师占专任教师总数的81.10%。拥有首批“全国黄大年式教师团队”1个，教育部长江学者创新团队2个，“青年长江学者”1人，国家教学名师1人，全国中医药高等学校教学名师1人，国医大师1人，全国名中医2人， 2人获教育部新世纪优秀人才支持计划；61位专家享受国务院政府特殊津贴；7人获卫生部有突出贡献中青年专家；1人获国家何梁何利基金奖；32人获得自治区突出贡献优秀专家称号；5个自治区级教学团队，16名自治区级教学名师，10名自治区级教学能手。2006年，学校以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估。2011年和2015年分别通过教育部口腔医学、中医学专业认证。2018年顺利通过本科教学审核评估。近年来，学校共获得自治区级教育教学成果奖27项，其中一等奖5项，二等奖8项，三等奖14项。
学校建有2个国家级实验教学示范中心，5个自治区级实验教学示范中心；现有省部共建国家重点实验室1个、国家级国际联合研究中心1个、教育部省部共建实验室1个、教育部国际合作联合实验室1个、教育部省部共建协同创新中心1个、教育部工程研究中心培育项目1个、自治区重点实验室13个、自治区研究所24个、教育厅重点实验室5个、校级实验室22个。
学校以医学学科为主，现有6个自治区“十三五”重点学科，其中2个高峰学科、4个高原学科；临床医学学科进入ESI全球排名前5‰；5个一级学科博士学位授权点，2个博士专业学位授权点；10个一级学科硕士学位授权点，8个硕士专业学位授权点；2个博士后科研工作站、3个博士后科研流动站。
学校立足新疆及周边地区重大疾病、特高发疾病防治和区域特殊药物资源开发开展研究，成绩斐然。2019年共立项项目448项，获得经费6095.55万元；横向项目18项，经费212.55万元；纵向项目共430项，获得科研经费共5883万元。其中，获得国家自然科学基金重大研究计划项目1项，项目经费337万元，为新疆医疗卫生行业首次获批该计划的项目。2019年，公开发表学术论文2812篇，其中核心1382篇，第一单位发表SCI 371篇，国际顶尖学术刊物BIOMATERIALS发表与中国药科大学最新合作成果。学校近2年在Science、Journal of Hepatology等国际顶尖学术期刊上发表高水平学术论文3篇，实现了新疆医科大学在生命医学研究领域重大突破。自治区科技进步奖数量连续十年蝉联全疆高校第一，2019年获各级各类成果奖32项。其中，自治区科技奖特等奖1项、一等奖2项、二等奖7项、三等奖8项。
学校共有实习基地68家，其中直属附属医院7所，非隶属附属医院6所。学校临床教学及实习基地集中了全疆优质资源、优势凸显，基本实现了“小病不出乡、大病不出县、疑难危重病不出疆”的目标。学校有6所直属附属医院为三级甲等医院，开放床位数近一万张，其中第一临床医学院（第一附属医院）在2019年荣获第十三届中国医院院长年会“中国医院质量管理奖（2019）卓越奖”，连续三届荣获中国医学人文大会“人文爱心医院”称号，在“2018中国医院竞争力•顶级医院100强”排名中位居第55位，在复旦版2018年度中国区域医院综合实力排行榜中位列西北第三；第二临床医学院（第二附属医院）是国家老年疾病临床医学研究中心新疆分中心、国家精神心理疾病临床医学研究中心新疆分中心、高级卒中中心、中国胸痛中心、自治区神经系统疾病临床医学研究中心、自治区重点实验室-新疆神经系统疾病研究重点实验室；第三临床医学院（附属肿瘤医院）是新疆维吾尔自治区癌症中心；第四临床医学院（附属中医医院）是国家中医临床研究基地、国家中医药传承创新工程重点中医医院、国家中医药优势特色教育培训基地、国家中药炮制传承基地、国家“中医药国际合作基地”、国家药物临床试验机构、国家卫生计生委关节镜诊疗技术培训基地、心血管疾病介入诊疗培训基地、脑卒中筛查与防治基地,并设有国家级博士后科研工作站；第五临床医学院（第五附属医院）是中国妇女发展基金会“母亲微笑行动”定点医院，国家卫健委颁发的改善医疗服务行动计划典型医疗机构；第六临床医学院（第六附属医院）是新疆维吾尔自治区脊柱外科研究所，新疆维吾尔自治区骨科医院，吉林大学-新疆医科大学国际联合医疗及研究中心。
学校不断加强与国内外知名高校的交流合作。2011年教育部确定中南大学、吉林大学、北京中医药大学为我校全面对口支援高校，同时还与复旦大学、中山大学、中国药科大学等20余所大学建立了长期援疆共建合作关系，各高校选派援疆干部专家实施精准援疆、目标援疆、团队援疆等形式，促进了学校办学水平的全面提升。
学校与美、俄、日、英、法、德、巴基斯坦等多个国家的大学及研究机构建立了校际合作关系。特别是近几年来，学校国际教育的规模和质量不断提升，学历被阿联酋、沙特、巴基斯坦、巴林等多个国家认可。目前，学校有含博士、硕士、本科层次学历教育留学生651人，被教育部授予首批接受政府奖学金的高校、来华留学生教育先进集体。2011年被批准成为自治区首批来疆留学高校示范基地。
依托现有12个国家临床重点专科和85个自治区临床重点专科，学校在周边国家及地区的影响力明显增强，为丝绸之路经济带核心区建设做出了突出贡献。
立足新时代，开启新征程，新疆医科大学将高举习近平新时代中国特色社会主义思想的伟大旗帜，紧紧围绕立德树人的根本任务，肩负“健康中国”的历史使命，不忘初心、矢志奉献，努力打造集医学教育、医疗服务、医学研究、健康产业“四位一体”的航空母舰，为新疆社会稳定和长治久安，为中华民族伟大复兴努力奋斗。