遵义医药高等专科学校于2006年2月17日经国家教育部批准，2006年6月20日正式挂牌成立，由原遵义卫生学校和原遵义中医学校两所国家级重点中专合并组建。学校现有占地面积1394亩，全日制在校高职生近10000人。
2008年，学校荣获国家卫生部“全国无偿献血先进促进奖”；2010年，学校通过了教育教学工作合格评估，2010年、2013年获全省“高职高专院校思想政治教育工作评估优秀”；2012年12月，学校获批为贵州省示范性高职院校；2012年获全省高校网站建设评比第一名；学校是全省精神文明建设工作先进单位、全省“安全稳定综合治理工工作先进单位。
经过多年的办学实践，遵义医专逐步探索出“中西药并举”、“专科教育为主、兼顾成人教育、中职教育为辅，兼顾职业教育培训”的办学路子，现开设有临床医学、临床医学(全科医学方向)、护理学、助产、中医学、针灸推拿、康复治疗技术、医学检验技术、医学影像技术、中药学、药学、医药营销、公共卫生管理、医学营养等14个专业和专业方向。其中，护理、医学影像技术专业为国家财政部重点支持建设的骨干专业，康复技术、针灸推拿两个专业为中央财政支持重点专业建设项目，中医专业获得贵州省开放性实训基地建设项目。
学校建立了多个专业基础实验室和校内专业实训室，一个国家级生药Ⅱ级实验室、一个省级动物实验中心、一个市校共建临床病理诊断中心、一个法医司法鉴定中心、贵州省第五职业技能鉴定站、遵义市遗体捐献中心。
学校紧紧依托“四位一体”办学模式形成了在教学、培训、实习实训等多层面、全方位的紧密型合作格局，校院、校企合作工作取得初步成效，我校近年来的办学效益已得到社会的广泛认可。近三年，学校第一志愿上线率达到100％以上，毕业生就业率在95％以上，做到了“进口旺，出口畅”。 学校现有2所直属附属医院、2所非直属附属医院，拥有74家覆盖所有专业的实习医院和基地。学生在“教学做”一体化的实验实训中夯实专业技能，做到学校里有病房，医院、药企里有课堂，实训教学实现了从学校到院（企），从模拟仿真岗位到职业岗位的无缝对接。
学校坚持“校院合作、专兼结合、重点培养、加强引进”的原则，积极探索适应高等职业教育需求的师资培养模式。大力推进“双师双职，校院共管”的运行机制，实现了双赢和共同发展，打造了一批特色鲜明的师资队伍，“登上讲台可教书育人，坐在诊室会把脉治病，走出校门能服务社会”。
学校现有专兼职教师678人，其中双师型教师578人，博士、硕士研究生99人，副教授以上239人。在专业教师中，“双师”素质教师占专业教师总数的88.43％，来自行企的兼职教师占专业教师总数的比例占27.3％。
2014年学校加大了双师型队伍的建设，成立了临床医学教学学院，将学校和附院的资源整合，对加强临床医学教育，强化临床医学生的医学理念和专业素质培养，全面提高医学生培养质量有重要意义。基础护理教学团队、中医临床教学团队获得省级优秀教学团队称号，学校还拥有省内高职院校唯一一支贵州省男性生殖力强弱科技人才培养创新团队。
遵义医专作为遵义市职业教育的骨干院校，在遵义市市委、市政府高度重视并大力支持下开启了遵义医专新蒲校区的建设，市委、市政府把遵义医专新蒲校区作为“交钥匙工程”，投入资金17亿元建设医专新校区。学校设计秉承了集约共享、校景共融、城校共生、文化传承的理念，设计是以黔北民居为基本风格，融合遵义红色文化元素，是集现代、古典、生态、人文为一体的医学人文校园。
2014年新蒲校区已经完成了一期工程的建设，4500余名新生已于2014年10月入住新校区。2015年元月，遵义医专原汇川校区、桃溪校区全部学生及教学系部、行政办公部门全部迁入新校区。至此，完全实现了“一校三区”的资源整合。遵义医专新蒲新校区的建设大大改善了学校的办学条件，为学校持续发展打下了坚实基础。
遵义医专人将抓住职业教育大发展的大好机遇，不断在革新中求发展，在发展中创特色，不断谱写卫生教育事业发展新篇章，力争通过“转型期”、“扩容期”与“提质期”三个发展阶段，为社会输送更多有用卫生人才，成为遵义市乃至贵州省高职教育的领头羊和排头兵。